Urodził się 18.06.1974. Pochodzi z rodziny z tradycjami gry na waltorni. Jego pierwszymi nauczycielami byli ojciec i brat. Następnie uczył się u prof. Jože Falout'a w Akademii Muzycznej w Ljubljanie (Słowenia), pod kierunkiem którego ukończył zarówno studia jak i studia podyplomowe. Studiował także u prof. Radovana Vlatković'a w Mozarteum w Salzburgu (Austia). Podczas studiów otrzymał nagrodę specjalną - Student Prešeren Award – za wykonanie Koncertu nr 1 Ryszarda Straussa z towarzyszeniem orkiestry Radia i Telewizji z Ljubljany.
Jako solista występował z wieloma orkiestrami, między innymi: Orkiestra Filharmoników Słowenii, Orkiestra Filharmoniczna z Mariboru, Dubrovnik Symphony Orchestra, Philharmonic Orchestra Udine, Chamber Orchestra Padova e Veneto oraz Jeunesses Musicales Orchestra. Współpracował z wieloma dyrygentami, jak na przykład: Anton Nanut, Uroš Lajovic, Marko Letonja, David de Villiers, S. Pelegrino Amato, Gary Brain, Amy Anderson, Yakov Kreizberg czy Sian Edwards. Jako solista gościnny występował między innymi w Operze w Brukseli oraz z Berlin Symphony Orchestra (BSO). Kontynuuje także współpracę z Mahler Chamber Orchestra. W roku 2001 zwyciężył w Międzynarodowym Konkursie Città di Porcia. Praktykę pedagogiczną rozpoczął w 1999 jako asystent, a następnie od 2004 starszy wykładowca Akademii Muzycznej w Ljubljanie. Od 2005 wykłada również w Akademii Muzycznej w Zagrzebiu (Chorwacja). W swoim dorobku artystycznym ma 5 płyt wydanych przez ZKP RTV Slovenia, - trzy solowe i dwie jako członek zespołów kameralnych (Slovenian Brass Quintet oraz Kwintet Dęty Ariart).
Jako członek zespołu Juvavum Brass wydał także płytę Salzburg Rarities. Od ponad dekady Boštjan Lipovšek jest solistą-waltornistą RTV Slovenia Symphony Orchestra, z którą nagrał wiele płyt, w tym z koncertami Ryszarda Straussa i Wolfganga Amadeusza Mozarta; dokonał także premier kompozycji L. Lebič’a, I. Petrić’a oraz U. Kreka.
